Fundado a 18 de Setembro de 1942, o Atlético Clube de Portugal é resultado da fusão de dois clubes da zona de Alcântara: o União Futebol de Lisboa e o Carcavelinhos Futebol Clube. 

Durante vários anos, os dois clubes mantiveram características idênticas de popularidade no bairro de Alcântara. A rivalidade foi-se acentuando, tomando proporções de verdadeiro derby cada vez que os dois clubes jogavam entre si. 

Mas foi após um desses jogos que a fusão entre os dois clubes aconteceu, dando origem ao Atlético Clube de Portugal. Em 1941, em Santo Amaro, União e Carcavelinhos disputaram entre si a Taça Manuel da Silva. O encontro terminou empatado, mas o União ofereceu a respectiva taça ao Carcavelinhos. Era o prelúdio da fusão, que culminou com a assinatura da escritura a 18 de Setembro de 1942. 

Após essa data, o Atlético Clube de Portugal deu início a um palmarés invejável. Ainda hoje adeptos, dirigentes, treinadores e jogadores classificam o clube como um histórico do futebol português. 

Embora não conte com qualquer vitória no Campeonato Nacional da I Divisão, as 24 presenças do Atlético nesta prova incluem inúmeras classificações honrosas, entre as quais vários terceiros, quartos e quintos lugares. Para além disso, a equipa da zona de Alcântara marcou presença em duas finais da Taça de Portugal, tendo sido derrotado em ambas. 

Relativamente ao Campeonato Nacional da II Divisão, o Atlético já soma três títulos e foi por duas vezes finalista vencido. 

O clube tem também uma preocupação acentuada nas camadas jovens. Desde sempre o Atlético procura desenvolver um trabalho que tenha reflexos não só nos resultados, mas fundamentalmente nos valores que se poderiam projectar no futebol nacional. 

Para além do futebol, o clube da zona de Alcântara tem-se realçado no basquetebol, no voleibol, no judo, no andebol e no futebol de cinco, desportos que deram vários títulos ao clube. 

Fora da actividade desportiva, o Atlético Clube de Portugal alcançou ainda dois feitos prestigiantes: em 1951 foi atribuído ao clube o grau de Oficial da Ordem Militar de Cristo, face ao esforços desenvolvidos em prol do desporto nacional; trinta anos mais tarde, em 1981, foi concedido ao Atlético Clube de Portugal o estatuto de Instituição de Utilidade Pública, através de uma declaração publicada no Diário da República.  

Finalmente, em 1992, a Câmara Municipal de Lisboa atribuiu ao clube a Medalha de Mérito Municipal, grau Ouro, tendo o Governo da República decidido galardoar o Atlético com a Medalha de Bons Serviços Desportivos. 

O Atlético Clube de Portugal possui 15 filiais. Em Portugal elas estão sedeadas em Arrentela, Arronches, Cacém, Pernes, Famalicão, Caselas, Porto, Aldeia Nova, São Romão, Porto Salvo e Covelo. No estrangeiro tem presença em antigas colónias: Guiné-Bissau, Cabo Verde, Moçambique e Macau. 

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