Os alemães foram a equipa mais ofensiva em campo e concretizaram o ascendente frente à equipa de André Villas-Boas na segunda parte.
Çalhanoglu fez as duas assistências, a segunda num livre, e
Donati, aos 58, e
Papadopoulos, aos 63, fizeram os golos que colocam o conjunto germânico no topo do grupo.
Wendell deixou o Bayer com menos um ao ver o segundo cartão amarelo, aos 79 minutos.
O defesa internacional português Neto sentou-se no banco, Danny foi titular.
O Bayer é líder com seis pontos, segue-se o Mónaco com cinco. O Zenit tem quatro e o Benfica um.