Wilson Eduardo vai representar a seleção de Angola. O extremo do Sp. Braga nasceu em Portugal, mas tem ascendência angolana e podia, portanto, representar qualquer uma das duas seleções.

Ao contrário do irmão João Mário, Wilson Eduardo nunca foi chamado à seleção portuguesa e vai assim representar os Palancas Negras.

Wilson Eduardo foi chamado para o jogo com o Burquina Faso, a 18 de novembro, de qualificação para a Taça das Nações Africanas de 2019.